1、不會影響年終獎，否則用人單位屬于克扣工資，勞動者可以到勞動監(jiān)察大隊投訴；

2、年終獎屬于獎金，是工資總額的一部分，產假是女性職工的帶薪假，產假期間相當于已提供正常勞動，用人單位未按約定標準向勞動者支付勞動報酬的，就是克扣工資；

3、法律依據《國家統(tǒng)計局關于工資總額組成的規(guī)定》

第四條　　工資總額由下列六個部分組成：

（一）計時工資；

（二）計件工資；

（三）獎金；

（四）津貼和補貼；

（五）加班加點工資；

（六）特殊情況下支付的工資。

第七條　　獎金是指支付給職工的超額勞動報酬和增收節(jié)支的勞動報酬。包括：

（一）生產獎；

（二）節(jié)約獎；

（三）勞動競賽獎；

（四）機關、事業(yè)單位的獎勵工資；

（五）其他獎金。

《工資支付暫行規(guī)定》

第十五條 用人單位不得克扣勞動者工資。有下列情況之一的，用人單位可以代扣勞動者工資：

（一）用人單位代扣代繳的個人所得稅；

（二）用人單位代扣代繳的應由勞動者個人負擔的各項社會保險費用；

（三）法院判決、裁定中要求代扣的撫養(yǎng)費、贍養(yǎng)費；

（四）法律、法規(guī)規(guī)定可以從勞動者工資中扣除的其他費用。

《勞動部對<工資支付暫行規(guī)定>有關問題的補充規(guī)定》

三、《規(guī)定》第15條中所稱“克扣”系指用人單位無正當理由扣減勞動者應得工資（即在勞動者已提供正常勞動的前提下用人單位按勞動合同規(guī)定的標準應當支付給勞動者的全部勞動報酬）。不包括以下減發(fā)工資的情況：

　?。?）家的法律、法規(guī)中有明確規(guī)定的；

　?。?）依法簽訂的勞動合同中有明確規(guī)定的；

　　（3）用人單位依法制定并經職代會批準的廠規(guī)、廠紀中有明確規(guī)定的；

　　（4）企業(yè)工資總額與經濟效益相聯(lián)系，經濟效益下浮時，工資必須下浮的（但支付給勞動者工資不得低于當地的最低工資標準）；

　?。?）因勞動者請事假等相應減發(fā)工資等。 查看更多